Năm 1991 đơn vị Vi phẫu được thành lập với nhiệm vụ khâu nối chi đứt rời. Năm 1994 thành lập labo vi phẫu để huấn luyện các bác sĩ vi phẫu phía nam, mỗi lớp vi phẫu kéo dài 3 tháng trong đó có 1 tháng thực hành trên labo và 2 tháng thực hành lâm sàng. Năm 1997 khoa Vi phẫu tạo hình được thành lập với 5 phẫu thuật viên và 30 giường bệnh, dưới sự lãnh đạo của bác sĩ chuyên khoa II Võ Văn Châu - nguyên trưởng khoa Vi phẫu tạo hình.