Phó Giáo sư Tiến sĩ Nguyễn Duy Huề sinh năm 1956 tại Thạch Lưu, Thạch Hà, Hà Tĩnh. Từ nhỏ, Duy Huề luôn là cậu học trò chăm ngoan, học giỏi, biết giúp đỡ gia đình và bạn bè. Tốt nghiệp phổ thông, Nguyễn Duy Huề đã chọn con đường trở thành người thầy thuốc để chữa bệnh cứu người. Đây là sự lựa chọn mà cho đến ngày hôm nay, ông vẫn cho là đúng đắn bởi nó xuất phát từ niềm tin và niềm đam mê.

Năm 1974, Duy Huề trở thành sinh viên của Trường Đại học Y Hà Nội. Tại trường ông luôn là một sinh viên chăm chỉ, miệt mài đèn sách. Tốt nghiệp năm 1980, bác sĩ trẻ Duy Huề tiếp tục thi đỗ học nội trú Bộ môn Điện quang. Trong điều kiện thiếu thiết bị học tập, nhưng với niềm tin và lòng đam mê với nghề y, ông luôn cố gắng và không ngừng học tập từ thế hệ thầy cô đi trước. Kết thúc khóa học năm 1983, bác sĩ Nguyễn Duy Huề về giảng dạy tại Bộ môn Điện quang nay là Bộ môn Chẩn đoán hình ảnh, Trường Đại học Y Hà Nội. Năm 1984, ông còn có thời gian tham gia nhiệm vụ quốc tế tại Lào.