Bác sĩ Nguyễn Minh Khánh tốt nghiệp xuất sắc tại Đại học Y khoa Claude Bernard Lyon I năm 2000. Năm 2008, anh theo học Phẫu thuật chung tại Khoa Y, Đại học Méditerranée (Aix-Marseille II) và đây cũng là nơi anh tiếp tục học chuyên khoa sâu về phẫu thuật Chấn thương Chỉnh hình. Anh cũng hoàn thành các chương trình đào tạo nâng cao về Nội soi khớp (của Hiệp hội Nội soi khớp Pháp),Phẫu thuật bàn tay, Bệnh lý về cơ xương khớp liên quan đến hoạt động thể thao (Đại học Y Marseille), Y học thiên tai (Đại học Paris XII), Y học và Vệ sinh nhiệt đới (Đại học Lyon).

Bên cạnh hoạt động chuyên môn, Bác sĩ Nguyễn Minh Khánh rất tích cực tham gia nghiên cứu, giảng dạy và cùng với các đồng nghiệp nước ngoài có nhiều bài báo cáo khoa học được công bố trên các tạp chí chuyên ngành trong và ngoài nước. Bác sĩ Khánh hiện đang công tác tại Khoa Chấn thương Chỉnh hình, Bệnh viện Huấn luyện Quân y Saint Anne, Toulon, Pháp và là thành viên của nhiều hiệp hội như Trường Phẫu thuật Chấn thương Chỉnh hình Pháp (CFCOT), Hiệp hội Phẫu thuật Chấn thương Chỉnh hình Pháp, Hiệp hội Nội soi khớp, Hiệp hội Phẫu thuật bàn tay Pháp, Hiệp hội Nội soi khớp cổ tay Châu Âu, Hiệp hội bác sỹ Quân Y Pháp.