Có nhiều năm kinh nghiệm trong ngành phẫu thuật tiêu hóa gan mật.

Bác sĩ chuyên khoa II Đặng Ngọc Hùng giữ vị trí cao cấp tại Viện 103 và Học viện Quân y, ông còn tham gia giảng dạy và là chủ nhiệm bộ môn Ngoại bệnh lý tại Học viện Quân y trước khi trở thành phó giám đốc học viện. Ông cũng đồng thời là phẫu thuật viên chính phẫu thuật lồng ngực, tim mạch, nội tiết từ năm 1982. Ông còn có nhiều kinh nghiệm và chuyên môn cao khi thực hiện các phẫu thuật liên quan đến những bệnh lý về ngực, phổi, tim, mạch máu cũng như Basedow, bướu cổ, tuyến ức. Trước khi được bổ nhiệm giám đốc bệnh viện Đa khoa tư nhân Hà Thành, ông đã từng là giám đốc bệnh viện Tim Đông Đô (giai đoạn 2009 - 2015).